Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms