Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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