Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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