Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RLFQ13129 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RLFQ13129 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RLFQ13129 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms