Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms