Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms