Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms