Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLTCQ00610 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms