Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms