Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms