Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms