Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms