Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG3P56975 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG3P56975 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRG3P56975 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms