Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA2P51531 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms