Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF4P18085 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF4P18085 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF4P18085 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms