Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPD1P17405 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPD1P17405 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms