Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms