Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4E171 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4E171 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms