Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms