Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms