Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms