Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNMT3BQ9UBC3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms