Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1EQ9GZS1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms