Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms