Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms