Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNAQ96QF7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms