Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OPALINQ96PE5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms