Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms