Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms