Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms