Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms