Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms