Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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