Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TUBB3Q13509 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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