Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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