Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms