Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms