Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD3P84022 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms