Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NESP48681 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NESP48681 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NESP48681 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NESP48681 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NESP48681 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms