Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms