Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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PTPRAP18433 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRAP18433 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRAP18433 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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