Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms