Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms