Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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