Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms