Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC144AA2RUR9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC144AA2RUR9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC144AA2RUR9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC144AA2RUR9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC144AA2RUR9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC144AA2RUR9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms