Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms