Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.3 ms