Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms