Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM8Q9NQV8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms